Caractérisation et identification morphologique, biochimique et moléculaire des champignons mycorhiziens de l’arganier dans trois régions de l’Algérie (Tindouf, Mostaganem et Chlef)

Abstract

L’étude vise l’isolement et la caractérisation des champignons mycorhyziens et endophytes associés aux racines d’arganier à travers les techniques morphologiques, biochimiques et moléculaire. La coloration des racines a montré la présence des champignons mycorhiziens et endophytes dans les trois régions avec une superiorité remarquable au niveau des racines provenant de Tindouf en termes de taux de mycorhization. Le tamisage humide des sols rhizosphériques a permet l’isolement et la caractérisation morphologique de seize espèces de champignons mycorhiziens appartenant aux cinq genres Glomus, Acaulospora, Gigaspora, Scutellospora, Entrophospora. L’analyse moléculaire a permet de confirmer l’identification de dix espèces. Le genre Glomus est le plus dominant dans les trois régions suivi du genre Acaulospora. De plus la région de Mostaganem est la plus riche en termes² de diversité en champignons mycorhiziens suivie de Chlef puis Tindouf. Quant à la caractérisation biochimique, l’analyse chromatographique des acides gras a permet de détecter l’acide palmitoléique (C16 :1ω5) avec des teneurs variables dans les trois régions d’étude. De même le dosage de l’ergostérol a révélé des teneurs variables dans les trois régions. La mise en culture des racines sur milieu PDA a permet d’isoler et d’identifier quatre espèces endophytes appartenant aux genres Penicillium et Aspergillus. L’analyse métagénomique de la communauté fongique endoracinaire, a montré que la majorité des OTU fongiques appartenaient au phylum Ascomycota et à Basidiomycota avec la dominance du genre Penicillium dans les trois régions