Mécanismes moléculaires de résistance aux antituberculeux chez Mycobacterium tuberculosis

Abstract

La tuberculose, causée par Mycobacterium tuberculosis (Mtb), continue d’être un problème majeur de santé publique à l’échelle mondiale. Les objectifs de cette étude étaient la caractérisation des profils phénotypiques et génotypiques ainsi que la diversité génétique de Mtb résistants aux antibiotiques isolés en Algérie. Dix isolats de Mtb multirésistants (MDR-TB) et un isolat mono-résistant à l'isoniazide (MR TB), isolés à partir de patients algériens atteints de tuberculose pulmonaire et extra-pulmonaire, ont été inclus dans cette étude. La détermination des profils phénotypiques de résistance des isolats a été réalisée par la méthode de proportion indirecte (MPI) sur gélose. Les mutations associées à la résistance aux antituberculeux ont été mises en évidence par la combinaison des tests de sondes linéaires, GenoType® MTBDRplus v2 et GenoType®MTBDRsl v2, le séquençage par la méthode de Sanger et le séquençage de nouvelle génération ciblant des amplicons de 15 locus. La diversité génétique des isolats a été caractérisée par la méthode de génotypage MIRU-VNTR. Les mutations les plus couramment associées à la résistance à la rifampicine (rpoB S531L), l'isoniazide (katG S315T et C15T dans le promoteur de inhA), la streptomycine (rpsL K43R, gidB V139A ou L16R et rrs A514C), l'éthambutol (embB M306V ou M306I), la pyrazinamide (pncA V155A ou T142M) et à l’ofloxacine (gyrA A90V), ont été identifiées. D’autres nouvelles et rares mutations ont été également trouvées dans les gènes rpoB (délétion 512-513-514), katG (S315R, M126I/R496L), gidB (V124G, E92A, V139A, G37V) et gyrA (P8A). L'analyse MIRU-VNTR a révélé que les souches de Mtb les plus répandues dans cette étude appartenaient aux lignées Cameroon (36%), et de Haarlem (36%), suivi par les lignées LAM (18%) et S (9%). Cette étude a établi, pour la première fois, les déterminants génétiques de résistances aux antituberculeux et la diversité génétique de la population de Mtb en circulation en Algérie. Bien que les résultats de cette étude puissent être utiles pour la mise en œuvre de mesures de contrôle de la tuberculose en Algérie, d’autres études d’épidémiologie moléculaire plus élargies sont nécessaires pour mieux comprendre l’épidémiologie de la tuberculose en Algérie.