Résumé:
La tuberculose, causée par Mycobacterium tuberculosis (Mtb), continue d’être un problème
majeur de santé publique à l’échelle mondiale.
Les objectifs de cette étude étaient la caractérisation des profils phénotypiques et génotypiques
ainsi que la diversité génétique de Mtb résistants aux antibiotiques isolés en Algérie.
Dix isolats de Mtb multirésistants (MDR-TB) et un isolat mono-résistant à l'isoniazide (MR
TB), isolés à partir de patients algériens atteints de tuberculose pulmonaire et extra-pulmonaire,
ont été inclus dans cette étude.
La détermination des profils phénotypiques de résistance des isolats a été réalisée par la
méthode de proportion indirecte (MPI) sur gélose. Les mutations associées à la résistance aux
antituberculeux ont été mises en évidence par la combinaison des tests de sondes linéaires,
GenoType® MTBDRplus v2 et GenoType®MTBDRsl v2, le séquençage par la méthode de
Sanger et le séquençage de nouvelle génération ciblant des amplicons de 15 locus. La diversité
génétique des isolats a été caractérisée par la méthode de génotypage MIRU-VNTR.
Les mutations les plus couramment associées à la résistance à la rifampicine (rpoB S531L),
l'isoniazide (katG S315T et C15T dans le promoteur de inhA), la streptomycine (rpsL K43R,
gidB V139A ou L16R et rrs A514C), l'éthambutol (embB M306V ou M306I), la pyrazinamide
(pncA V155A ou T142M) et à l’ofloxacine (gyrA A90V), ont été identifiées. D’autres nouvelles
et rares mutations ont été également trouvées dans les gènes rpoB (délétion 512-513-514), katG
(S315R, M126I/R496L), gidB (V124G, E92A, V139A, G37V) et gyrA (P8A).
L'analyse MIRU-VNTR a révélé que les souches de Mtb les plus répandues dans cette étude
appartenaient aux lignées Cameroon (36%), et de Haarlem (36%), suivi par les lignées LAM
(18%) et S (9%).
Cette étude a établi, pour la première fois, les déterminants génétiques de résistances aux
antituberculeux et la diversité génétique de la population de Mtb en circulation en Algérie. Bien
que les résultats de cette étude puissent être utiles pour la mise en œuvre de mesures de contrôle
de la tuberculose en Algérie, d’autres études d’épidémiologie moléculaire plus élargies sont
nécessaires pour mieux comprendre l’épidémiologie de la tuberculose en Algérie.
